Высокопроизводительная генетика: предложен новый алгоритм, ускоряющий экспериментальное аннотирование функций гена

Успехи в технологиях секвенирования позволили получить доступ к геномам тысяч микроорганизмов и сделать их общедоступными, однако задача присвоения функций новым генам до сих пор не решена. Для решения проблемы, ученые из Национальной лаборатории Лоуренса Беркли (Berkeley Lab) и исследователи Объединенного института генома Министерства энергетики США (DOE) (JGI), разработали алгоритм, который позволяет определилять предполагаемые белки репарации ДНК и предлагать конкретные функции для слабо аннотированных ферментов и транспортеров и для нехарактеризованных семейств белков. Исследование, опубликованное в журнале Nature 16.05.2018 является самым большим исследованием по функциональной геномике бактерий, из когда-либо опубликованных, и включает идентификацированные мутантные фенотипы для 11 779 белок-кодирующих генов. Узнать больше